Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms