Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms