Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms