Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms