Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cdh23Q99PF4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh23Q99PF4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms