Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf3Q99P51 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms