Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln4Q99NB8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubqln4Q99NB8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms