Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaipQ99ME3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms