Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms