Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lysmd3Q99LE3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lysmd3Q99LE3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms