Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms