Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms