Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TrabdQ99JY4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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