Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms