Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pacsin3Q99JB8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pacsin3Q99JB8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pacsin3Q99JB8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pacsin3Q99JB8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pacsin3Q99JB8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pacsin3Q99JB8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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