Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Def8Q99J78 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Def8Q99J78 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Def8Q99J78 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Def8Q99J78 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Def8Q99J78 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Def8Q99J78 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Def8Q99J78 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Def8Q99J78 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms