Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms