Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms