Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc30a1Q99J38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc30a1Q99J38 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms