Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Cldn16Q925N4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms