Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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