Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp3Q923K4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtpbp3Q923K4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms