Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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