Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms