Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms