Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms