Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms