Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms