Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms