Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ApofQ91V80 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApofQ91V80 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms