Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms