Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms