Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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