Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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Slc6a20aQ8VDB9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Slc6a20aQ8VDB9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Slc6a20aQ8VDB9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Slc6a20aQ8VDB9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Slc6a20aQ8VDB9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Slc6a20aQ8VDB9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a20aQ8VDB9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Slc6a20aQ8VDB9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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