Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmprss4Q8VCA5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms