Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup58Q8R332 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms