Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms