Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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