Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms