Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms