Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Scara5Q8K299 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Scara5Q8K299 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Scara5Q8K299 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Scara5Q8K299 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Scara5Q8K299 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Scara5Q8K299 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scara5Q8K299 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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