Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim68Q8K243 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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