Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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