Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc47a1Q8K0H1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms