Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tbc1d23Q8K0F1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tbc1d23Q8K0F1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms