Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FgbQ8K0E8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FgbQ8K0E8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FgbQ8K0E8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms