Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms