Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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