Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp2Q8CGR7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms