Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lsm14bQ8CGC4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lsm14bQ8CGC4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lsm14bQ8CGC4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm14bQ8CGC4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lsm14bQ8CGC4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lsm14bQ8CGC4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lsm14bQ8CGC4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lsm14bQ8CGC4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lsm14bQ8CGC4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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